Jan Bouwen heeft een master in de Sociale en Organisatiepsychologie aan de UCL en bezit ook een MBA-diploma van De Vlerick Leuven-Gent Management School. Tussen 1995 en 1997 verdiepte Bouwen zich aan de KU Leuven in de Toegepaste Economische Wetenschappen. In februari 2002 behaalde hij aan dezelfde universiteit zijn doctoraatsdiploma in de Toegepaste Economische Wetenschappen. Aan de KU Leuven was Bouwen assistent bij de afdeling Personeelsmanagement van het departement TEW.
De voorbije zes jaar werkte Bouwen bij Terumo, eerst als HR Director EMEA en later als Vice President Global HR Business Partners. Van 2008 tot 2014 was hij aan de slag bij Ingersoll Rand als Director HR ESA en vanaf 2010 als Vice President EMEA Talent, Learning en OD. Daarvoor werkte hij iets meer dan een jaar bij Agfa Healthcare als Global HR Director. Bij Brambles Industrial Services (Waterloo) was hij van september 2003 tot februari 2005 actief als HR-manager, onder meer voor de Benelux. Van oktober 2001 tot augustus 2003 was Bouwen managementadviseur bij het Brusselse kantoor van Arthur D. Little.
Sinds september is Bouwen is Global Vice President HR bij grafische groep Esko.