Tony Vandeputte studeerde filosofie aan de KU Leuven en vervolgens rechten (doctoraat), notariaat (licentiaat) en economie (licentiaat) aan dezelfde universiteit. In Edinburgh werd hij Master of Science in de economie.
Hij begon zijn carrière als expert bij het Planbureau, was enige tijd secretaris en secretaris-generaal bij CEPESS en trad in 1980 in dienst van het VBO. Net op de dag waarop zijn ontslag bekend gemaakt werd, publiceerde De Morgen nog een opmerkelijk interview met Vandeputte. Daarin ging hij de confrontatie aan met de federale regering over de aangekondigde loonlastenverlaging. Voor Vandeputte moet deze vooral ten goede komen van (beter betaalde) kennis- en kaderjobs en dus niet van de laaggeschoolden. Hij wijst ook elk werkgeversengagement om een bepaald aantal nieuwe banen te scheppen af.